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1.
Rev. argent. microbiol ; 49(1): 7-14, mar. 2017. ilus, tab
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1041775

ABSTRACT

Se evaluaron 3 metodologías de extracción de proteínas para la identificación de hongos miceliales por MALDI-TOF MS en 44 aislados: la extracción con agua-ácido fórmico (E. agua), la extracción con zirconio-etanol-acetonitrilo-ácido fórmico (E. zirconio) y la recomendada por el proveedor del equipo (E. tubo). Se compararon 2 bases de datos: Bruker (BK) y BK + National Institutes of Health. Los resultados obtenidos utilizando dichas bases fueron los siguientes (en el orden citado): identificación correcta (IC) a nivel de género, 10 y 16 con E. agua; 27 y 32 con E. zirconio y 18 y 23 con E. tubo; IC a nivel de especie, 5 y 7 con E. agua; 17 y 20 con E. zirconio y 11 y 14 con E. tubo; identificaciones no confiables, 18 y 12 con E. agua y 9 y 4, tanto con E. zirconio como con E. tubo; ausencia de pico, 16 con E. agua, 8 con E. zirconio y 17 con E. tubo. La extracción con zirconio mostró el mejor rendimiento (p < 0,05).


In order to optimize the identification of molds with MALDI-TOF MS, three protein extraction-methodologies were evaluated against 44 isolates: water extraction (WE), zirconium extraction (ZE) and the provider's recommended method (PRM). Two data bases were compared, Bruker (BK) and Bruker + National Institutes of Health. Considering both databases, results were respectively as follows: correct identification (CI) at gender level, 10 and 16 by WE; 27 and 32 by ZE and 18 and 23 by PRM; CI at species level, 5 and 7 by WE; 17 and 20 by ZE and 11 and 14 by PRM; non-reliable identification, 18 and 12 by WE; 9 and 4 by ZE and by PRM. No peaks were observed in 16 by WE, 8 by ZE and 17 by PRM. ZE showed the best perfomance (p < 0.05).


Subject(s)
Proteins/analysis , Mycelium/classification , Fungi/classification , Mass Spectrometry/methods , Databases, Factual/statistics & numerical data
2.
Rev. chil. infectol ; 33(1): 71-74, feb. 2016. ilus
Article in Spanish | LILACS | ID: lil-776962

ABSTRACT

We present the case of a patient with endocarditis and arthritis caused by extended spectrum β-lactamase producing non-Typhi Salmonella, with incomplete response (defined as persistence of Salmonella in joint fluid) to initial instituted treatment (trimethoprim-sulfamethoxazole) and posterior recovery with ertapenem. The disease was associated with implantable central venous catheter infection. Five percent of patients with non-Typhi Salmonella gastroenteritis develop bacteremia. Infective endocarditis and joint infection has been reported in 1,4% and less than 1% of cases, respectively.


Se presenta el caso de un paciente con endocarditis y artritis séptica por Salmonella no Typhi productora de β-lactamasas de espectro extendido que presentó una respuesta incompleta (definida como la persistencia de Salmonella en el líquido articular) al tratamiento inicial con cotrimoxazol y que posteriormente mejoró con ertapenem. La enfermedad se asoció al uso de un catéter venoso implantable. El 5% de los pacientes con gastroenteritis por Salmonella no Typhi desarrolla una bacteriemia. La endocarditis infecciosa y la artritis ha sido reportada en 1,4-5% de los casos y en menos de 1%; respectivamente.


Subject(s)
Aged , Humans , Male , Arthritis/microbiology , Endocarditis/microbiology , Salmonella Infections/microbiology , Salmonella/enzymology , beta-Lactamases/biosynthesis , Fatal Outcome , Salmonella/isolation & purification , Tomography, X-Ray Computed
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